小指关节疼痛的原因有以下三点：一、小指关节的外伤，小指关节出现损伤之后，可以导致关节囊周围的肿胀、疼痛，甚至伴有活动的受限，这时候可以采取活血化瘀、消肿止痛的中药进行外敷治疗。二、是类风湿性关节炎，可以通过查血类风湿因子来确定，类风湿性关节炎可以采取抗风湿的治疗。三、是骨性关节炎，也就通常所说的骨质增生，这种情况引起的关节疼痛，可以用扶他林外擦的办法来进行治疗。