一般来说大部分肛瘘是由直肠肛管周围脓肿引起，脓肿自行破溃处或者是切开引流处形成外口，位于肛周的皮肤。但是由于外口的生长比较快，瘘管常常呈假性的愈合，导致脓肿反复发作破溃，形成多个瘘管和外口，使单纯性肛瘘变为复杂性肛瘘。瘘管有反应性致密纤维包绕，近管腔处为炎性肉芽组织，后期部分管腔可以呈上皮化。而且在临床上，结核、溃疡性结肠炎、克罗恩病等特异性炎症，恶性肿瘤、肛管外伤感染也可以引起肛瘘，但是比较少见。一般来说，只要患者得了肛瘘，一定要到正规医院进行就诊，进行手术治疗，这样的话患者才会健康顺利的恢复。