亚急性甲状腺炎轻症患者可适当休息，给以非甾体类抗炎镇痛药，疗程约两周；全身症状较重、发热、甲状腺肿大、压痛明显者，可用糖皮质激素治疗，首选泼尼松，每天20~40毫克，用药后数小时至数日可缓解疼痛、甲状腺肿缩小，用药1~2周后逐渐减量，疗程2~3个月。但停药后部分患者反复，再次用药仍然有效；也可合用非甾体类抗炎镇痛药。伴有甲状腺功能亢进时，不需服用抗甲状腺药物，必要时可给予小剂量普萘洛尔；出现一过性甲减者，可适当服用左甲状腺素钠片，直到甲状腺功能恢复正常；发生永久性甲减者需终身左甲状腺素钠片替代治疗。