单磷酸阿糖腺苷临床主要用于治疗慢性乙型肝炎和其他病毒性感染，如带状疱疹、单纯疱疹、生殖器疱疹等。此外在手足口病儿童、水痘方面也有一定的疗效。不良反应如下：可出现注射部位的疼痛，极少数情况下会出现神经肌肉疼痛及关节疼痛，偶尔也会出现血小板减少，白细胞减少或骨髓细胞增多现象。停药后可自行恢复为可逆性，必要时可对症治疗，不良反应与用药量及疗程成正相关。