细菌性结肠炎的治疗主要包括以下几个方面：一、针对不同的细菌引起的肠炎，采取不同的抗感染治疗方案，常用的抗生素包括喹诺酮类的、氨基糖苷类的和抗厌氧菌的；二、对症治疗，轻度脱水或者是呕吐不严重的，可以适当的口服补液，如果脱水比较严重而且患者呕吐腹泻严重，这时应该静脉补液治疗，同时要纠正电解质紊乱和酸碱失衡；三、使用一些调节肠道微环境，或者是恢复肠道功能的药物，如双歧杆菌、枯草杆菌；四、可以使用一些止泻药物，如蒙脱石散。