射精时龟头尿道口疼，可能是感染因素引起的。正常情况下射精一般不会引起明显的疼痛感，射精时局部疼痛主要考虑和细菌感染有关，比如膀胱炎、精囊炎、前列腺炎、尿道炎、前列腺增生、肾盂肾炎有可能引起疼痛症状。除此以外，尿路结石、膀胱结核也会导致患者射精时尿道口或龟头部位疼痛，比如平常不注意个人清洁卫生，膀胱、尿道受到细菌感染后，导致局部充血、水肿、排尿或射精刺激使局部疼痛。需要就诊于医院男科，可以进行尿常规检查，如果发现里面白细胞增多，主要考虑和感染因素有关。