甲状腺炎根据病因和病程分为急性甲状腺炎、亚急性甲状腺炎和慢性甲状腺炎，根据不同的病因、不同的诊断，进行不同的治疗。如果临床诊断为急性甲状腺炎，常见的病因是细菌感染、结核感染，因此给予抗感染治疗。如果诊断为亚急性甲状腺炎，病因目前尚没有阐述清楚，病毒感染可能是主要的诱因，因此要抗病毒治疗，同时给予非甾体类的消炎药进行抗炎、对症处理。若诊断为慢性甲状腺炎，还要根据不同的发病机制，再进一步的分型，慢性甲状腺炎常见的原因是自身免疫性的甲状腺炎，当自身免疫性甲状腺炎、甲状腺功能正常时，则不需要药物治疗，仅定期随诊即可，影响到甲状腺功能出现甲减时，则给予甲状腺素的替代治疗，因此甲状腺炎不同的病因、不同的甲状腺功能状态时，治疗不同。