小儿疱疹性咽峡炎是由于柯萨奇A组病毒所传染的感染性疾病，一般不建议在没有经过医生指导的情况下自行选择药物。如患儿临床症状比较明显，可以选择抗病毒的药物、中成药药制剂如抗病毒口服液、双黄连口服液等。疱疹性咽峡炎可以引起继发细菌感染，可以加用抗生素或者是中药制剂，具有消炎作用的药物，比如阿莫西林、头孢克肟或者蒲地蓝消炎片等。此外，一些喷剂对小儿疱疹性咽峡炎的恢复也很有帮助，常用的有干扰素喷剂，开喉剑喷剂等。疱疹性咽峡炎多会引起患儿反复发热，对发热超过38.5摄氏度以上的患者，也可以口服退热药物，常见的有布洛芬、对乙酰氨基酚等进行退热治疗。以上提到的药物大多为处方药，一般需要医生根据孩子的具体病情不同指导选择使用。疱疹性咽峡炎生病期间多会发热，咽痛，家长需要留意监测孩子的体温变化，如神状态等情况，需要尽量患儿多休息，注意补充水分，饮食清淡为主。患病期间可多吃蔬菜，多补充维生素，多吃水果提供能量，促进疾病更快的恢复。咽痛明显影响进食的可以短期内流食为主，避免进食烫和酸的食物，以免加重患儿咽喉不适。