扁桃体充血，有可能是病毒或者细菌感染引起的，也有可能和胃酸反流刺激有关，具体如下：1、如果病程时间比较短，有感冒受凉的病史，主要临床症状是咽喉疼痛、吞咽困难。通过肉眼或者查体，看到扁桃体红肿、充血，那么这种情况，就要考虑是急性扁桃体炎。病原体考虑是细菌，或者病毒感染。治疗方面，需要使用抗生素抗炎治疗，抗病毒药物，配合糖皮质激素、雾化消肿等对症处理。2、如果病程时间比较长，同时有慢性胃炎、胃酸反流、咽喉部烧灼感等情况，扁桃体充血，则要考虑是胃酸刺激引起的。需要给予抑制胃酸、促进胃动力药物对症治疗。所以对于扁桃体充血，还需要根据不同的原因，对症处理。