病毒性甲状腺炎的治疗主要是对症治疗，可以通过多饮水促进病毒的排除，服用非甾体的抗炎药进行退热的止疼的治疗，必要的时候可以应用糖皮质激素进行治疗。如果出现甲状腺功能减退症，还可以服用小剂量的是左甲状腺素钠片进行替代治疗。如果出现心慌等甲状腺毒症的症状，还可以服用盐酸普耐洛尔进行对症治疗。病毒性甲状腺炎是一个病毒感染的疾病，因此它是有自限新的，一般在临床上可以表现为发热，脖子痛和甲状腺毒症的症状。化验室指标表现为甲状腺功能亢进症，但是甲状腺的摄碘率是下降的，这是典型的分离现象。