小腿毛囊炎的治疗方案需要根据患者的具体情况来具体分析。如果是糠秕孢子菌毛囊炎，需要在治疗前化验真菌予以确认。在治疗方面可以外用盐酸特比萘芬软膏、盐酸特比萘芬喷雾剂、酮康唑洗剂、克霉唑软膏或者萘替芬酮康唑软膏，可以口服伊曲康唑胶囊一天一次，一次两粒。对于痤疮丙酸杆菌感染引起的毛囊炎，需要在治疗前化验伍德灯检查，如果检查是阳性，即可确认，可以口服异维A酸胶囊或者盐酸米诺环素以及外用克林霉素磷酸酯凝胶、夫西地酸软膏、复方多粘菌素B软膏或者莫匹罗星软膏。