吃四联药物的副作用主要就是会表现大便颜色发黑，同时也可能会有稀便或者是出现有上腹不适，上腹疼痛等异常症状。应用的抗菌药物主要就是容易引起恶心、呕吐，或者是口苦等异常表现。有些患者应用克拉霉素，还会导致腹泻。另外应用呋喃唑酮，有些患者还会出现类似感冒的症状。停止应用这些药物后，这些症状也会逐渐消失。但是如果患者表现的副作用比较严重，必要的情况下也可以适当的调整抗菌药物的种类，杀除幽门螺旋杆菌，才能有效促进胃部疾病的好转，避免发生病变。