肛瘘的发病很复杂，现在机理不明确，临床上主要以肛腺的感染为主，肛腺长在肛门内，一般看不到，而且肛腺它的作用，跟腮腺的作用是一样，会分泌一些液体软化大便，肛腺口张开细菌进去以后就容易造成感染。这种感染首先表现的是肛周脓肿，就是肛门周围起疖子，但是大部分离肛门近的疖子，基本上都考虑是由肛周感染而来，这种情况必须要手术。但是急性期过后，脓肿自然破溃就形成了肛瘘，也根据情况有的肛瘘瘘口特别远，有的肛瘘瘘口特别近。特别远的这一种保守治疗其实效果不是很好，还是要切开，但是因为它距离远，所以切开以后复发的几率也比较大。外口比较近的这种一般都选择肛瘘的手术治疗，而且是一次性根治术，因为距离比较短，完整切开提出瘘管以后愈合的时间也比较短，治愈率非常高。就这种近距离的肛瘘和肛周脓肿，一般不建议保守治疗，都建议早期手术根治，因为早手术、早发现、早治疗这样伤口会比较小，愈合的速度也比较快。如果长期带有肛瘘会影响生活质量，另外，肛瘘会不不断的形成新的窦道，时间长了以后会变成复杂性肛瘘，现在复杂性肛瘘是目前国内的疑难杂症之一，在世界也是世界公认的一种疑难杂症，治疗起来非常的不方便，而且患者特别痛苦，尤其是瘘管特别复杂的。选择医院切除肛瘘，瘘管可能会造成括约肌的损伤，导致排便失禁，所以选择手术和选择手术方式，选择手术医生都非常的重要，总之，这个病还是要依靠手术治疗。