可用于治疗支原体感染的抗生素包括大环内酯类、四环素类、喹诺酮类及其他一些抗生素。由于支原体不含有细胞壁，对作用为抑制细胞壁合成的抗生素耐药，故临床不应选择磺胺类、利福平、β~内酰胺类、甲氧苄氨嘧啶等抗生素。对于支原体感染的患者，临床应根据支原体培养及药物敏感试验，寻求最敏感的抗生素治疗，一般疗程为两周左右。