引起扁桃体肥大的常见原因有生理性肥大，儿童较为多见，较小的儿童扁桃体没有萎缩，因此可见扁桃体肥大，而且其可以为一度二度或三度大，但是这种情况一般并没有其他不适症状。但是也有部分生理性肥大，如在三度发时有可能会影响呼吸，容易有打鼾现象，这是因为其阻塞呼吸道原因而出现打呼噜，张口呼吸等这类症状。另外一种原因是由于扁桃体发炎而致使其肥大，比如某些细菌感染，而且这种症状常会造成明显不适感，会出现局部疼痛、吞咽疼痛、甚至伴有发烧发热等这类症状。