发生扁桃体炎时会以咽喉部的剧烈疼痛为主，严重的可以出现发热、畏寒、全身乏力、食欲减退、腹痛、腹泻等全身症状。咽喉炎一般没有明显的全身症状，以咽喉部的异常感觉为主，比如异物感、痒感、微痛感、干燥感，在晨起时可以由于咽部的分泌物刺激而导致干咳，严重的伴有干呕症状，通过喉镜检查是最直接判断两类疾病的方法。扁桃体炎是较小的范围，咽喉炎范围更加广泛，可能咽喉炎已经包含扁桃体炎的情况。前者的治疗方式是以发生感染时应用抗生素为主，发作频繁的选择手术。后者的治疗方式主要以祛除病因为主，减少进食辛辣刺激性食物，戒除烟酒，有明显恶心、反酸的要使用抑制胃酸及促进胃肠道动力药物。