阴茎疼痛用什么药物，还应该根据病因进行选择的。如果是由于细菌感染所造成的龟头炎或者毛囊炎的话，可以外用抗生素软膏，或者是带有局麻药物的抗生素软膏，比如林可霉素利多卡因凝胶，进行抗炎治疗，炎症消退之后，阴茎疼痛的症状就会逐渐缓解和消失的。如果是由于带状疱疹病毒感染所引起的阴茎疼痛，主要应该选择抗病毒的药物治疗为主，可以局部使用抗病毒的软膏，也可以口服营养神经，抗炎镇痛的药物对症治疗。