射精后肚子疼常常提示有慢性前列腺炎，病人发生慢性前列腺炎时，由于感染性炎性物质沿输精管进入精液中，引起精液感染。当射精时致病微生物到达后尿道后，会刺激后尿道引起尿道刺痛症状。由于精液部分流入到后尿道、膀胱中会引起膀胱区疼痛，引起射精后肚子疼。病人出现射精后肚子疼时需及时到泌尿外科就医，通过选择有效的抗生素，如磷霉素氨丁三醇散、头孢克洛缓释片、阿莫西林胶囊等药物序贯治疗四周左右，多数病人射精后肚子疼症状会彻底好转。