脸上长扁平疣是由人类乳头瘤病毒感染引起的，一般可通过直接传染和间接传染而患病。 直接传染就是人与人直接接触传染，间接传染就是通过病毒污染过的某些生活用品而传染。如果皮肤有破损，这时破损处要是直接或间接接触过扁平疣的话，人类乳头瘤病毒就很可能会通过破损的皮肤进入皮肤或黏膜的上皮细胞内，而后在细胞内不断的繁殖，导致被感染的上皮细胞无法正常的生长且死亡，进而使上皮细胞过度增生形成扁平疣。