类风湿性关节炎的患者当进展到晚期时，主要通过手术以及药物的治疗。发展到晚期的类风湿性关节炎，会出现严重的关节畸形，从而导致患者的关节出现严重的功能障碍甚至残疾，并且出现剧烈的疼痛症状。此时可以通过口服非甾体类抗炎药物以及免疫抑制剂来控制症状。另外通过手术来缓解病情的发展，矫正关节的畸形，从而尽可能地恢复关节的功能。常用的手术方法用关节镜下滑膜切除与清理术以及关节置换术。