拉肚子可以吃肠道微生态制剂，如复方嗜酸乳杆菌，双歧杆菌，酪酸菌等，或者是黄连素，蒙脱石散等。还可以选择头孢或左氧氟沙星，抗结核药物，氨基水杨酸类药物，糖皮质激素，免疫抑制剂，生物制剂等治疗。具体药物的选择要根据病因进行。拉肚子可以是因为急性胃肠炎，胃癌，萎缩性胃炎，胃切除术后，细菌性痢疾，肠结核，肠易激综合征，肠道菌群失调，溃疡性结肠炎，克罗恩病，嗜酸性粒细胞胃肠炎，结肠息肉，结肠癌，回盲部切除术后，阿米巴结肠炎，放射性肠炎，肠淋巴瘤，类癌，盲袢综合征等胃肠道疾病引起。也可以是因为肝，胆道，胰腺疾病引起，如慢性肝炎，长期阻塞性黄疸，肝硬化，慢性胰腺炎，肝癌，胆管癌，胰腺癌等。或者是一些全身性疾病，如甲状腺功能亢进症，糖尿病，尿毒症，系统性红斑狼疮，结节性多动脉炎，混合性风湿免疫疾病，动脉粥样硬化，食物过敏，慢性肾上腺皮质功能减退，甲状旁腺功能减退症等引起。