厌氧菌感染是很多种疾病的总称，因为厌氧菌种类很多且感染部位也很多，所以很难对厌氧菌感染做出首选用药的选择，还要根据具体情况来具体分析，选择相应的抗菌药物。临床上可以用来治疗厌氧菌的药物主要包括以下几类：1、咪唑类抗菌药物，比如甲硝唑、奥硝唑，氯霉素对厌氧菌的效果也比较好。2、碳青霉烯类抗菌药物，比如亚胺培南、美罗培南。还有青霉素类药物，比如氨苄西林舒巴坦也可以有效治疗厌氧菌感染。3、克林霉素、头孢西丁等。