早上醒来发生口臭的原因有以下几种：1、晚上熬夜，消化功能不良的病人早晨起来容易出现口臭。2、睡觉睡的比较晚，吃饭吃的也比较晚，并且睡觉前没有进行体育锻炼，吃完饭就睡觉，早上容易出现消化功能不良的现象，会出现口臭。3、口臭的发生也有可能由于晚上刷牙刷的不彻底，食物残渣残积在口腔内，细菌发酵食物残渣以后产生口臭。4、睡觉后唾液腺分泌唾液的功能减弱，唾液分泌减少，冲刷和清洗作用减弱，也容易发生口臭。所以综上，如果发现早晨起来发生口臭，应适度调理自己作息以及饮食习惯，避免熬夜。晚上睡觉前可以吃清淡的食物，患者要做到认真的刷牙，可以祛除口臭的现象。