肺部炎性肉芽肿的治疗主要是根据病因来选择一些措施。通常，如果是由于细菌感染所引起，应该选择敏感的抗生素，比如青霉素类、头孢菌素类、大环内酯类或者喹诺酮类的药物。如果是真菌感染所引起的炎症，应该及时的选择两性霉素B、灰黄霉素。如果是结核分支杆菌感染引起的肺部的结核性的肉芽肿，应该及时的联合多种抗结核药物治疗，比如包括异烟肼、利福平、已胺丁醇、吡嗪酰胺、链霉素、丁胺卡那霉素、左氧氟沙星等药物。此外，如果是由于类风湿性关节炎导致的肺部的炎性肉芽肿，应该给予一些糖皮激素，比如地塞米松、甲基强的松龙等，必要时联合免疫抑制剂，比如环磷酰胺、硫唑嘌呤来进行治疗。