睡觉时肛门坠痛需要明确病因，再选择对症用药，每种病因服用的药物是有区别的。肛门坠痛有可能是痔疮、肛周脓肿、溃疡性结肠炎等原因引起。需要前往肛肠科完善肛门指诊、肛门镜、电子肠镜等相关的检查，明确病因。如果是痔疮脱出肛门引起的疼痛，可以口服活血化瘀的中药，例如槐角丸，结合用痔疮栓、痔疮膏治疗。肛周脓肿起初形成时，可以口服抗生素，例如阿莫西林、左氧氟沙星控制炎症，后期需要做手术切开排脓。溃疡性结肠炎引起的肛门坠胀，可以口服美沙拉嗪等药物治疗。