一般来说，如果肾结石小于0.5公分，可以通过多喝水、多运动，然后药物治疗可以达到比较好的保守的效果，但是石头如果大于5个毫米，需要在医生的建议下根据石头的成分、大小、数量来选择合适的治疗方法。对于原发性的高钙尿，可以使用噻嗪类和枸橼酸钾来治疗。另外对于肾小管中毒主要使用碱性药物来减慢结石生长和新发结石的形成，纠正代谢失调。对于原发性高钙酸尿的结石治疗比较困难，可以尝试使用维生素B从小剂量开始随效果减退而不断的加量，同时大量的饮水限制富含草酸的食物，可使尿液中的草酸水平降至正常。另外高尿酸尿需要低嘌呤食物，大量的饮水可以降低尿酸的浓度。胱氨酸尿结石适当的限制蛋白质的饮食。然后感染性的结石可以根据患者的情况可以将结石取出，然后选择适宜的抗生素来控制尿路感染。