蚓激酶肠溶胶囊，主要用于调理胃肠道，所以在服用的时候也会有一定的副作用，具体副作用有以下几点：1、由于药物时直接作用于肠道，就会导致肠道上的一些刺激。肠道受到刺激就会出现恶心、呕吐、腹泻以及大便次数增多。2、药物一般是由肝脏代谢，肾脏排出，所以可能会导致患者肾脏、肝脏出现损伤。3、部分患者可能会出现过敏的反应，比如出现皮疹、皮肤瘙痒等症状。4、部分患者也可能会出现头疼、头晕等症状。