高锰酸钾、痔疮膏、消炎的抗生素软膏等药物可以治疗肛裂。肛裂的形成与便秘有关，可以用高锰酸钾兑温水局部坐浴，改善肛周的血液循环，擦干后裂口表面涂抹痔疮膏，例如复方角菜酸酯软膏。也可以涂抹消炎类的抗生素软膏、例如莫匹罗星软膏、红霉素软膏等，对于治疗肛裂效果也是比较好的。如果便秘严重的患者，可以口服润肠通便的药物，例如麻仁丸，乳果糖口服液等。