屁眼疼比较常见的原因：1、由于肛裂的存在，就是在肛门口的位置形成了皮肤的裂口。2、痔疮所致。痔疮发生了脱出，出现了血液循环的障碍，或者外痔的部分有水肿、血栓、发炎。3、肛门周围感染性疾病，比如说皮脂腺、毛囊感染，或者肛门周围脓肿、直肠黏膜下脓肿。在发生屁眼疼痛以后，建议患者早到正规医疗机构的肛肠科进行就诊，一般通过肛门局部的望诊、肛门的指检、肛门镜的检查，就可以明确诊断，主要通过药物治疗或者进行手术治疗。