阴茎上面长了小水泡一样的东西可能是生殖器疱疹，是一种比较常见的性传播疾病，主要为不洁净的性接触所引起。应当去医院的泌尿外科或男科进行疱疹病毒抗体检测。如果确诊为生殖器疱疹，可使用外涂药物进行治疗，比如阿昔洛韦软膏，治疗周期为1~2周，症状会逐渐消失。如果生殖器疱疹比较严重，也可通过注射干扰素的针剂进行治疗。在治疗期间，患者应避免进行性生活，防止出现交叉感染。