巧克力囊肿并不一定需要做手术，需要根据囊肿的大小、患者的年龄是否有生育要求而综合决定。如果巧克力囊肿比较小，而且为单侧的，近期又有备孕计划的女性，可以考虑以备孕为主，正常性生活一年如果可以怀孕，对巧克力囊肿也有一定的治疗作用。如果备孕一年没有怀孕的女性，在排除男方因素导致的不孕，这时可以选择手术治疗。手术中需要了解巧克力囊肿的情况，与周围组织是否有粘连，可以考虑行巧克力囊肿剥除术，如果有粘连时，可以给予粘连分解。