抗甲亢药物主要有两种：甲巯咪唑，丙硫氧嘧啶。主要作用机制是抑制甲状腺过氧化物酶的活性，这种酶是甲状腺激素合成的关键酶。药物可以作用于甲状腺细胞抑制新的甲状腺激素合成，但对于已经合成的甲状腺激素没有影响。血液中甲状腺激素的半衰期是7天，加之甲状腺内储存的甲状腺激素释放约需要两周时间，所以药物开始发挥作用多在4周以后。应用药物治疗甲亢的治愈率50%左右，但药物治疗存在副作用，如白细胞低，过敏，肝损伤等，停药后甲亢复发率50%。