三层自建房在建造时应该考虑到避雷问题，因为雷电是一种非常危险的自然现象，可以对建筑物和人造成严重的破坏和伤害。以下是三层自建房需要注意的避雷问题：

1．避雷针的安装：避雷针是一种用来保护建筑物免受雷击的设备，可以将雷电引入地下，避免对建筑物造成伤害。因此，在建造三层自建房时，应该考虑安装避雷针，以保护房屋和居住者的安全。

2．金属屋顶的选择：金属屋顶是一种较好的避雷方式，因为金属是导电材料，可以将雷电引入地下。因此，在建造三层自建房时，可以选择金属屋顶，以增加房屋的避雷能力。

3．安全接地系统的建设：安全接地系统是一种用来将雷电引入地下的设备，可以保护建筑物和居民的安全。在建造三层自建房时，应该考虑建设安全接地系统，以增加房屋的避雷能力。

总之，三层自建房应该考虑避雷问题，采取一些措施来保护房屋和居民的安全。这些措施包括安装避雷针、选择金属屋顶、建设安全接地系统等。