肛门疼的原因有很多，常见的有以下几种：一、如果患者有直肠下段的癌肿，浸润肛管会引起剧烈的疼痛，由于肛门括肌的收缩还会使疼痛加剧。二、如果患者既往有痔疮，大便干结容易使痔核淤积肿胀，局部感染形成脓肿以后表现为肛周质硬的包块，也会引起肛门疼痛。三、如果患者蹲坐、异物损伤，比如刀枪损伤肛门，从而会见有裂口，表现为肛门周围疼痛。出现肛门疼痛，可以通过视诊、直肠指诊，必要时行辅助检查比如肛周彩超等可以明确诊断。