龟头起小水疱在临床上也比较常见，一般考虑两种情况。1、常规因素；这类患者一般都伴有包皮过长，由于日常生活中清洁不到位，包皮垢堆积、与龟头摩擦等因素可导致龟头起小水疱，这种水疱呈非透明样、散在分布，并且疼痛感不是特别明显。2、性病可能：生殖器疱疹，这种水疱多呈现为成簇分布，水疱透明，疼痛感较明显，此类患者一般有明确不洁性交史，属性传播疾病，患者可先自我检查。建议到正规医院及时就诊，明确诊断并治疗。若为包皮清洁不到位所致可先保守治疗，如调整饮食，减少刺激性食物，保持清洁等。