帮助毁灭证据罪被批捕的处罚是会处以三年以下有期徒刑或拘役。帮助当事人毁灭、伪造证据罪，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役。司法工作人员犯该罪的，从重处罚。

【法律依据】

根据《刑法》第三百零七条，帮助当事人毁灭、伪造证据罪，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役。