肛门囊肿是由于以下一些原因引起：1.先天发育异常。有些肛门囊肿是先天发育异常形成的，例如骶前囊肿，会出现反复的感染。2.感染因素。例如肛门周围皮肤的皮脂腺出现感染，就会形成皮脂腺囊肿。囊肿内为豆腐渣样感染物，并且会逐渐增大，也会出现急性的感染，导致局部肿痛，甚至形成脓肿。还有肛腺感染也会导致肛管直肠周围形成脓肿，会表现为肛门周围剧烈的红肿、疼痛症状。肛门囊肿大多数需要通过手术治疗才能完全治愈，患者需要先去医院就诊，明确诊断后再采取相应的治疗措施。