在临床上，莫匹罗星软膏的正确使用方法如下：这个药物是外用，主要是局部涂抹于患处，用于革兰氏阳性球菌引起的皮肤感染，必要的时候可以在患处用敷料包扎或者覆盖。根据病情，在医生指导下，选择外用的时间和频率。这个药物可以外用于脓疱病，疖肿，毛囊炎等原发性皮肤感染及湿疹合并感染，不超过10厘米×10厘米面积的浅表性创伤合并感染等继发性皮肤感染。而且在使用这个软膏时，只能皮肤给药，不能用于眼，鼻，口等黏膜部位，也不能用于身体插管附近的皮肤。