肛门疼痛的原因有很多，需要询问病史，结合查体以及辅助检查明确诊断：一，如果患者存在外力击打或者异物损伤的病史，尤其是木棍或者刀枪侵入肛门直肠，有时可以见到局部裂口，有时会引起肛门部疼痛。二，如果患者存在直肠恶性肿瘤，下段直肠癌容易侵犯肛管，表现为质硬的包块，触之伴疼痛。三，如果患者存在痔核反复脱出肛门，不能还纳，局部肿胀水肿，淤血形成血栓，表现肛周质硬的肿物，色紫，触之伴疼痛，用力排便时疼痛会逐渐加重。