哺乳期肠炎的药物选择主要看肠炎的严重程度，如果是轻微的感染，大多通过调整饮食可以自行恢复，药物上面可以服用蒙脱石散，针对腹泻吸收肠道内的水分。还可以通过乳果糖口服液调节肠道功能，也可以选择一些对哺乳影响的抗菌素进行抗炎治疗。