霓虹燕子的疾病有很多，用的药也不一样，常用的杀菌药主要是黄粉、土霉素、庆大霉素等等。

通常在霓虹燕子的患病初期，不需要下药治疗，而是先给它换水，保持水质的干净卫生，有助于它的康复。其次要适当升温，提高鱼儿的抵抗力。并往水中适当下盐，浓度控制在千分之三到千分之五。

而在霓虹燕子患病中后期，则需要对症下药。