云南闭壳龟是浅水养的，主要生活在在溪流、湖泊和或沼泽湿地。平时喜在杂草丛中的乱石堆里隐居而不易被人们发现，它是杂食性龟类，以小鱼、虾、蚯蚓、水果、蔬菜等为食，也可投喂人工佴料。

云南闭壳龟闭合龟壳时，既可进行自我保护，又是御敌的有力武器。在遇到敌害时，它立即将头、尾、四肢缩入甲壳内，腹甲与背甲相合，关闭甲壳，形成一个盒状结构。若受到蛇侵犯时，它们关闭甲壳，正好夹住蛇，直到蛇死亡，然后死去的蛇就成为它的美餐了。