鞭蝴蝶鱼性情温和，只要避免和具攻击性的大鱼混养，基本没什么问题，尽量选择体型相似、性格相近的品种比较好。

此外，饲养鞭蝴蝶鱼的时候，要注意它们需要足够的躲藏地点及活动空间，所以水族箱尽量大一些，至少要250升以上，另外注意不要放入珊瑚缸，因为鞭蝴蝶鱼会吃珊瑚、海葵和硬珊瑚。