人工养殖的长吻海蛇，可以利用海中的小鱼、小虾，以及浅海地区廉价的软体动物作为它们的食物，还可以喂食一些鱼卵以及海边廉价的肉类。

野生环境下的长吻海蛇主要以小型鱼类为食，例如鳗尾鲶，也会捕食甲壳类动物等。