扁尾陆龟腐皮的治疗方法如下：

1、彻底清除病灶，用药涂抹伤口，一天一次，扁尾陆龟要是吃食就在食物中加土霉素，将病龟隔离。可以隔天泡一次澡，但是不要放在水中饲养，待恢复后再放入水中。

2、用药可以选择聚维酮碘、红霉素眼药膏、金霉素眼膏、百多邦。不用重复用药，选择其中一种药物即可。最好每天用高锰酸钾溶液来泡一泡养龟的器具。