雄性海南闪鳞蛇体长865mm，雌性海南闪鳞蛇体长610mm。

海南闪鳞蛇背面蓝褐色，有金属光泽，两侧最下3行背鳞间有1～2条断续白纵纹，最下一行背鳞灰白色；腹面灰白色，尾后段尾下鳞蓝褐色。头背蓝褐色，头腹浅蓝灰色或浅褐色。头较小而略扁，吻端圆纯，躯干圆柱形。