男性膀胱部位隐隐的疼可由以下几种原因引起：1.急性膀胱炎此时往往伴有尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状，可出现膀胱的充血水肿而引起疼痛症状；2.泌尿系结石比如输尿管结石若在输尿管膀胱开口处，发生嵌顿，可引起膀胱区隐痛；3.前列腺炎急性或慢性前列腺炎时，由于炎症波及膀胱部位，表现为膀胱部位隐痛；4.膀胱恶性肿瘤晚期膀胱癌患者也会出现膀胱区隐痛症状；5.邻近脏器波及患者可出现消化道症状，常可波及膀胱周边，引起该部位疼痛。