EB病毒感染导致化脓的治疗，与患者基本状态有关。在临床上，EB病毒不属于化脓感染性病毒，较少引起化脓性感染，但部分患者可因局部咽喉部严重病变，合并其他病原微生物感染，可出现化脓感染症状。一般情况下，需要对咽喉部化脓性分泌物进行取样，并进行病原微生物检测。如果化验结果提示合并细菌感染，则需根据药敏检查结果，选择有效抗生素进行抗感染治疗。如化验结果仅支持病毒感染，则缺乏特异性治疗，以对症支持治疗为主。