急性鼻窦炎多由上呼吸道感染引起，细菌和病毒感染可同时并发，常见的细菌菌群是肺炎链球菌、溶血性链球菌和葡萄球菌等多种化脓性球菌；其次为流感嗜血杆菌和卡他菌属，后者常见于儿童，其它的致病菌还有链球菌类、厌氧菌和金黄色葡萄球菌，有牙病引起者多属于厌氧菌感染，脓液常带恶臭，真菌过敏也可能是致病因素。慢性鼻窦炎由急性鼻窦炎转变而来，多应对急性鼻窦炎治疗不当，或对其未进行彻底治疗以致反复发作，迁延不愈，使之转化为慢性，此为本病的首要病因，阻塞性鼻炎鼻腔内的阻塞性疾病，如鼻息肉、鼻甲肥大、鼻腔结石等，致病菌毒力强以及牙源性感染、外伤和异物，鼻窦解剖因素不利于通气引流，也为不可忽略的自身因素，还包括全身性因素，各种慢性疾病、营养不良、疲劳过度等。