扁桃体上有水疱形成是由于受到了病毒感染所导致的，在治疗方面需要使用抗病毒的药物，常用的是利巴韦林颗粒或者是泛昔洛韦颗粒，也可以口服蒲地蓝消炎口服液，要有选择性的应用。同时可以在口腔内喷用西瓜霜喷雾剂或者是利巴韦林气雾剂每，积极治疗一周左右病情应该会有好转，在此期间可能会出现高热的情况，如果体温超过38°可以口服洛索洛芬钠片进行解热镇痛治疗。患者应该多喝水这样有利于疾病的恢复，在此期间饮食也要注意不要吃辛辣、刺激的食物，以免加重病情。